Na de klassieke humaniora studeerde Patrick Windmolders regentaat muzikale opvoeding aan het Lemmensinstituut te Leuven. Aan het conservatorium te Antwerpen studeerde hij, naast harmonie en muziekgeschiedenis, koordirectie bij Roger Leens en Johan Van Bouwelen. In Tilburg volgde hij masterclasses ‘early vocal music’ bij Rebecca Stewart.

Als dirigent werkte hij met het Jeugdkoor Martijntje uit Stevoort, het St.-Leonarduskoor te Zoutleeuw, Pro Musica uit Beverst, Vocant Antwerpen en Laetare Musica Herk-de-Stad.  Hij leidde projecten voor kinder-, jeugd- en volwassenkoren, beluisterde audities  en zetelde in jury’s in zowat alle Vlaamse provincies voor de federatie Koor&Stem, het Europees JeugdMuziekfestival te Neerpelt, La fédération à Coeur Joie (Fr.), de Kooracademie, Europa Cantat.

Hij werkt mee aan projecten van het Euterpe Baroque Consort, vzw Muzikamp, de Limburgse Oratoriumvereniging, het conservatorium te Antwerpen, het Hermesensemble.

Hij is verbonden aan de Kunsthumaniora Antwerpen als leraar koor, muziekesthetica, creatief musiceren en algemene muziekleer. Momenteel concerteert hij met de koren A-koor Antwerpen, het concertkoor van de Kunsthumaniora Antwerpen en het vocaal ensemble Reflection.

Patrick Windmolders wordt regelmatig gevraagd als project- en atelierleider voor Koor&Stem, o.m. voor de Koordagen voor kinderen, Wetteren en Het Koorweekend voor het hele gezin, Waregem.
In 2008 leidde hij de 'Study tour' voor jeugdkoordirigenten op Europa Cantat Junior- Nevers.